А вот такой вопрос, если дистанционный работник трудится на Крайнем Севере, то ему положен районный коэффициент и процентная надбавка?

И если выплаты положены, но работодатель-то вообще не знает, где трудится работник, он же дистанционный, удаленный, тогда что?

как доказать работодателю? если отказывает...

Носом работодателя в ТК РФ ткнуть, как ещё то докажешь? Пусть потом он доказывает обратное.